洁净医学实验室承担着各类医疗机构的样本检测、医疗科学和医疗技术研究、医疗人才培养等重要工作，是各类医疗机构建设不可缺少的组成部分，本文所涉及的洁净医学实验室主要包括以下类型的实验室：无菌实验室、PCR实验室（基因扩增实验室）、生物治疗中心、PET中心（正电子发射计算机断层显像中心）、生物安全实验室。
无菌实验室主要是指用于微生物学、生物医学、生物化学、动物实验、基因重组以及生物制品等研究使用的实验室，这类实验室通常为正压实验室，主要的参考标准为《洁净厂房设计规范》GB50073-2013、《洁净室施工及验收规范》GB50591-2010。
PCR实验室（基因扩增实验室）是指通过扩增检测特定的DNA或RNA，进行疾病诊断、治疗监测和预后判定等的实验室，这类实验室通常为负压或者相对负压实验室，主要的参考标准为《临床基因扩增检验实验室管理暂行办法》（卫医发〔2010〕194号）。
PET中心（正电子发射计算机断层显像中心）是集核物理、放射化学、分子生物学、医学影像学和计算机等高新技术之大成，从分子水平上反映人体的生理、病理变化、代谢改变的显像实验室，PET中心设计的主要的参考标准为《药品生产质量管理规范（2010年修订）、《开放型放射性物质实验室辐射防护设计规范》EJ380-1989。
生物安全实验室是从事对实验人员和环境有一定危害的生物因子操作的实验室，生物安全实验室根据所从事的生物因子的危害性分为4个级别，这类实验室通常为负压实验室，主要的参考标准为《实验室 生物安全通用要求》GB19489-2008、《生物安全实验室建筑技术规范》GB50346-2011、《医学实验室安全认可准则》CNAS-CL36（ISO15190:2003），生物治疗中心和HIV实验室（性病、艾滋病实验室）均属于生物安全实验室，生物治疗中心是指采用生物免疫疗法治疗治疗各类疾病的实验室，HIV实验室（性病、艾滋病实验室）是指从事性病、艾滋病研究的实验室。
