手术区皮肤消毒后即开始铺盖无菌(意思:没有活菌)（fungus)巾。手术室装修确保手术台洁净度达标，一般多采用垂直层流式效果较好 层流手术室是一个"正压"环境，其空气压力根据其不同区域（如手术间、无菌准备间、刷手间、麻醉间和周围干净区域等）洁净度不同要求而不同。手术室净化高效安全的手术室空气净化系统，保证手术室的无菌环境，可以满足器官移植、心脏、血管、人工关节置换等手术所需的高度无菌环境。采用高效低毒消毒剂，以及合理使用，是保障一般手术室无菌环境的有力措施。其目的是除显露手术切口所必需的皮肤区以外，遮盖住其他部位，避免和尽量减少手术中的污染。小手术仅盖一块孔巾即可，较大手术，除手术野外，至少要有两层无菌(意思:没有活菌)（fungus)单遮盖。一般的铺巾方法如下:用四块无菌巾，每块的一边双折1/4，掩盖手术切口周围，每侧铺滚一块无菌巾。通常先铺相对不洁区(如会阴部、下腹部)，再铺操作者的对面，最后铺靠近操作者的一侧。
以腹部手术为例，先用二块中无菌(意思:没有活菌)（fungus)单，将接近切口布单的一侧边缘折过1/3，使之成为双层，然后适当地将无菌(意思:没有活菌)（fungus)单分别置于切口的上下方，足侧超过手术台，头侧超过麻醉（anesthesia)架。手术室净化手术室须严格划分为限制区(无菌手术间)、半限制区(污染手术间)和非限制区。三区分隔开的设计有二：一为将限制区与半限制区分设在不同楼层的两部分，这种设计可彻底进行卫生学隔离，但需二套设施，增加工作人员，管理不便；二为在同一楼层的不同段设限制区和非限制区，中间由半限制区过渡，设备共用，这种设计管理较方便。再用二块小无菌（fungus)单，也将边缘折I/4成双层，分别置干切扣的两侧，并超过手术台左、右两侧的边缘。继用巾钳将无菌（fungus)单四个相交处固定。其后参加消毒人员重新浸袍手臂，再穿手术衣和戴手套，最后将带孔的大无菌（fungus)单的开口准确的放在切口部位，然后将其展开，大单的头端应盖过麻醉（anesthesia)架，两侧及足端应垂下，超过手术台边缘30cm。
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