新风机组和循环机组中需要监控的参数有送风温湿度、新风量、各种阀门的开度等，各参数自动控制的实现方式如下：
1)送风温度的控制：控制温度变化的主要是对表冷器阀门的开度进行调节。将出风口温度传感器放置在每间洁净手术室的高效过滤器前，这样能有效的测定出最后进入室内的温度值，以减少在风道中能童消耗所带来的误差。国家标准中对手术室空气温度的规定是22-26℃，适当的温度有些时候是决定手术成功与否的重要因素。
2)送风·湿度的控制：整个空调系统的湿度控制由电加湿器进行调节，空气湿度大小对病菌存活时间有很大影响，根据国标的要求，Ⅰ级和Ⅱ级手术室要求室内的相对湿度值范围为40-60%。Ⅲ级和Ⅳ级手术室要求室内的相对湿度值范围在35-60%。为了使湿度值更能符合系统的要求，系统设定湿度值变化范围为45-55%。
3.低于100级的洁净区，当集中布置送风口时，送风口内末级高效过滤器可以集中布置，也可以分散布置，但在送风面上必须设置均流层。
4.洁净手术部所有洁净室，应采用双侧下部回风；在双侧距离不超过3m时，可在其中一侧下部回风，但不应采用四角或四侧回风。洁净走廊和清洁走廊可采用上回风。
5.下部回风口洞口上边高度不应超过地面之上，洞口下边离地面不应低于。Ⅰ级洁净手术室的回风口宜连续布置。室内回风口气流速度不应大于，走廊回风口气流速度不应大于3m／s。
6.洁净手术室均应采用室内回风。不设余压阀向走廊回风。8洁净手术室必须设上部排风口。
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